Se realizaron una serie de catas para documentar la posible existencia de dos líneas de fachada superpuestas (dos estructuras paralelas) que no eran visibles desde el interior de la nave en su fachada Norte. Las catas confirmaron la presencia de una doble estructura.
Hay muchos datos que parecen indicar que el primitivo edificio de la nave principal no era exactamente una iglesia cristiana. La tipología de arcadas abiertas desde el Norte, incluso la posibilidad de que ésta estructura se prolongara incluso más al Norte, podría corresponderse con una antigua mezquita. Por otro lado si las arcadas no estuvieran abiertas en toda su altura y se tratara de un salón, el uso original pudo haber sido el de sinagoga, al menos en la fase en la que se hicieron los contrafuertes exteriores y posiblemente arcos fajones interiores, y recordaría a la disposición de la sinagoga documentada recientemente en Lorca.